L’alitosi può essere causata fondamentalmente da due condizioni una orale ed una extraorale. La condizione extraorale più frequente è data dal riflusso gastro esofageo che può essere dovuto a molteplici cause e sulle cui origini il medico più indicato ad indagare è il gastroenterolo.
La condizione intraorale invece più frequentemente si ha in presenza di malattia parodontale (parodontite o più comunemente piorrea) o in presenza di restauri che non consentono una corretta igiene orale.